Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Otud5Q3U2S4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Otud5Q3U2S4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otud5Q3U2S4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms