Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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