Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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