Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3TTL0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3TTL0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3TTL0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms