Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms