Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms