Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms