Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Spatc1Q148B6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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