Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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