Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAY3

Fam187b, Protein FAM187B, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam187bQ0VAY3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam187bQ0VAY3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms