Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf541Q0GGX2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms