Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
F13bQ07968 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms