Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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MestQ07646 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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MestQ07646 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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MestQ07646 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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MestQ07646 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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MestQ07646 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MestQ07646 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms