Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms