Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Thbs3Q05895 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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