Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms