Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms