Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mmp11Q02853 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Mmp11Q02853 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Mmp11Q02853 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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