Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms