Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GscQ02591 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms