Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms