Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms