Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms