Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms