Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
F8a1Q00558 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms