Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms