Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AlkP97793 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AlkP97793 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AlkP97793 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AlkP97793 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AlkP97793 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AlkP97793 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms