Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prop1P97458 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prop1P97458 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms