Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms