Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms