Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dpf3P58269 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms