Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms