Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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