Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rad23aP54726 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.4 ms