Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms