Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VdrP48281 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VdrP48281 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VdrP48281 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms