Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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