Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SrprbP47758 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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