Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 361.4 ms