Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms