Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms