Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cd28P31041 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd28P31041 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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