Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VtnP29788 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VtnP29788 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VtnP29788 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VtnP29788 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VtnP29788 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VtnP29788 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VtnP29788 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VtnP29788 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VtnP29788 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VtnP29788 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VtnP29788 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VtnP29788 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms