Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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