Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PdgfraP26618 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms