Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RarbP22605 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RarbP22605 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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RarbP22605 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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RarbP22605 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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RarbP22605 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RarbP22605 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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