Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TP20293 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TP20293 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TP20293 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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TP20293 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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TP20293 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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TP20293 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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TP20293 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TP20293 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TP20293 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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