Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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P20040 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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P20040 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P20040 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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