Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ms4a1P19437 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a1P19437 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms