Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms